Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKRN4PQ13434 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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