Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ENOSF1-221ENST00000585004 1501 ntTSL 210.38□□□□□ -0.758e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 WDR37-205ENST00000482165 586 ntTSL 311.82□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 SIN3B-208ENST00000596638 1104 ntTSL 58.09□□□□□ -1.116e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 CDC14A-201ENST00000336454 4137 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.122e-7■■■■□ 23.1
TARDBPQ13148 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.086e-11■■■■□ 23.1
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TARDBPQ13148 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.343e-8■■■■□ 23
TARDBPQ13148 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 23
TARDBPQ13148 PRKCA-203ENST00000578063 1733 ntTSL 1 (best)17.13■□□□□ 0.334e-7■■■■□ 23
TARDBPQ13148 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 57.51□□□□□ -1.214e-7■■■■□ 23
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TARDBPQ13148 TOP1-201ENST00000361337 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.047e-7■■■■□ 23
TARDBPQ13148 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.078e-7■■■■□ 23
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TARDBPQ13148 MAPKAPK5-204ENST00000547915 1360 ntTSL 36.39□□□□□ -1.398e-7■■■■□ 23
TARDBPQ13148 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.627e-7■■■■□ 23
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TARDBPQ13148 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.37e-7■■■■□ 23
TARDBPQ13148 SNX13-202ENST00000409604 4146 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.687e-7■■■■□ 23
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TARDBPQ13148 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.897e-7■■■■□ 23
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TARDBPQ13148 SNX13-201ENST00000409076 3818 ntTSL 28.03□□□□□ -1.127e-7■■■■□ 23
TARDBPQ13148 SNX13-208ENST00000482558 1139 ntTSL 27.33□□□□□ -1.247e-7■■■■□ 23
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TARDBPQ13148 UBE2H-203ENST00000472396 758 ntTSL 520.3■□□□□ 0.845e-7■■■■□ 23
TARDBPQ13148 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.418e-7■■■■□ 23
TARDBPQ13148 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.185e-7■■■■□ 23
TARDBPQ13148 UBE2H-209ENST00000496698 561 ntTSL 47.69□□□□□ -1.185e-7■■■■□ 23
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TARDBPQ13148 SH3BP2-208ENST00000504294 557 ntTSL 514.2□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 23
TARDBPQ13148 SH3BP2-222ENST00000512014 688 ntTSL 312.73□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 23
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TARDBPQ13148 TCF12-222ENST00000561152 675 ntTSL 525.31■■□□□ 1.647e-7■■■■□ 22.9
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TARDBPQ13148 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.411e-6■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 ZNF292-208ENST00000518845 277 ntTSL 320.77■□□□□ 0.922e-6■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 ZNF292-203ENST00000369578 1732 ntTSL 216.09■□□□□ 0.172e-6■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 ZNF292-207ENST00000496806 770 ntTSL 314.44□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.252e-6■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 22.9
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TARDBPQ13148 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.197e-7■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 GRB10-214ENST00000465602 381 ntTSL 56.51□□□□□ -1.377e-7■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 PARN-215ENST00000569444 783 ntTSL 35.57□□□□□ -1.527e-7■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 TPST2-205ENST00000442495 586 ntTSL 222.02■■□□□ 1.122e-6■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 TPST2-207ENST00000450022 544 ntTSL 320.65■□□□□ 0.92e-6■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 TPST2-204ENST00000440953 544 ntTSL 518.36■□□□□ 0.532e-6■■■■□ 22.9
TARDBPQ13148 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 22.9
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