Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUSP4Q13115 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DUSP4Q13115 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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