Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIK2Q13002 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK2Q13002 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms