Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.81□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 SYH1YPL105C 2550 nt1.81□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.81□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 HER1YOR227W 3741 nt1.81□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 SSD1YDR293C 3753 nt1.81□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 APL1YJR005W 2103 nt1.81□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 CTR9YOL145C 3234 nt1.8□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 LHS1YKL073W 2646 nt1.8□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 YGL182CYGL182C 324 nt1.8□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 FRK1YPL141C 2598 nt1.8□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 VPS13YLL040C 9435 nt1.8□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 UTP8YGR128C 2142 nt1.79□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 MSH6YDR097C 3729 nt1.79□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 SEC31YDL195W 3822 nt1.79□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 RPL37BYDR500C 267 nt1.79□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 QCR9YGR183C 201 nt1.79□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 RTT107YHR154W 3213 nt1.79□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.78□□□□□ -2.12
MSL5Q12186 BRE1YDL074C 2103 nt1.78□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.77□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 FIG2YCR089W 4830 nt1.75□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 SPP41YDR464W 4308 nt1.75□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 NUP157YER105C 4176 nt1.75□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 HIR3YJR140C 4947 nt1.75□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 SAC3YDR159W 3906 nt1.75□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 GCN2YDR283C 4980 nt1.74□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.74□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 ADR1YDR216W 3972 nt1.74□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 IRC20YLR247C 4671 nt1.74□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 UBP2YOR124C 3819 nt1.74□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 DNF1YER166W 4716 nt1.74□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 MYO4YAL029C 4416 nt1.73□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.73□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.73□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.73□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 PEP1YBL017C 4740 nt1.72□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 UFD4YKL010C 4452 nt1.72□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 YDL206WYDL206W 2289 nt1.72□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.72□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.72□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 FAB1YFR019W 6837 nt1.72□□□□□ -2.13
MSL5Q12186 STB6YKL072W 2301 nt1.71□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt1.71□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt1.71□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.71□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 snR39BsnR39B 96 nt1.71□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 STF2YGR008C 255 nt1.7□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.7□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 SPO24YPR036W-A 204 nt1.7□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 UBR2YLR024C 5619 nt1.7□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 SFB2YNL049C 2631 nt1.69□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 YLL020CYLL020C 306 nt1.69□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 SMC1YFL008W 3678 nt1.69□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 PKH3YDR466W 2697 nt1.69□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 BFR2YDR299W 1605 nt1.69□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 UFD2YDL190C 2886 nt1.69□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 YOR093CYOR093C 4947 nt1.68□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.68□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.68□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 MYO2YOR326W 4725 nt1.68□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 RCO1YMR075W 2055 nt1.68□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 NUP192YJL039C 5052 nt1.67□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 TAH1YCR060W 336 nt1.67□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 COA6YMR244C-A 315 nt1.67□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 FKS1YLR342W 5631 nt1.66□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 RAD50YNL250W 3939 nt1.66□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 snR45snR45 172 nt1.66□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 YLR419WYLR419W 4308 nt1.66□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 RSM22YKL155C 1887 nt1.66□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 SEC63YOR254C 1992 nt1.66□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 UTP21YLR409C 2820 nt1.65□□□□□ -2.14
MSL5Q12186 DGR1YNL130C-A 147 nt1.65□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 TRM3YDL112W 4311 nt1.64□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 SEY1YOR165W 2331 nt1.64□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.63□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 HUG1YML058W-A 207 nt1.62□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 SEC21YNL287W 2808 nt1.62□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 snR81snR81 201 nt1.61□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 COX5BYIL111W 456 nt1.61□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 SMC4YLR086W 4257 nt1.6□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 TDA9YML081W 3756 nt1.6□□□□□ -2.15
MSL5Q12186 EAF1YDR359C 2949 nt1.58□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 YML002WYML002W 2214 nt1.58□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.58□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 MMS4YBR098W 2076 nt1.58□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 TBS1YBR150C 3285 nt1.58□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 snR14snR14 160 nt1.57□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 DNF3YMR162C 4971 nt1.57□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 YAR009CYAR009C 3591 nt1.57□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 POL5YEL055C 3069 nt1.56□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 YJR039WYJR039W 3366 nt1.56□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 SLX4YLR135W 2247 nt1.56□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 GEA2YEL022W 4380 nt1.55□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 PMD1YER132C 5262 nt1.54□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 FYV10YIL097W 1551 nt1.54□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 NUT1YGL151W 3399 nt1.54□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 YDR210WYDR210W 228 nt1.53□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt1.53□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 YLR232WYLR232W 348 nt1.53□□□□□ -2.16
MSL5Q12186 YNL266WYNL266W 420 nt1.53□□□□□ -2.16
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