Protein–RNA interactions for Protein: Q12072

IOC2, ISWI one complex protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IOC2Q12072 RPA190YOR341W 4995 nt3□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 MDM1YML104C 3384 nt2.99□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.99□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.99□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 PRP8YHR165C 7242 nt2.99□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 PDR3YBL005W 2931 nt2.99□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 MSH5YDL154W 2706 nt2.98□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 KCS1YDR017C 3153 nt2.98□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 RGA1YOR127W 3024 nt2.98□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 ALY2YJL084C 3141 nt2.97□□□□□ -1.93
IOC2Q12072 YLR278CYLR278C 4026 nt2.96□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 EST1YLR233C 2100 nt2.96□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 BUB1YGR188C 3066 nt2.96□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 ECM29YHL030W 5607 nt2.96□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 BNR1YIL159W 4128 nt2.95□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 DSE4YNR067C 3354 nt2.95□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 RGC1YPR115W 3252 nt2.94□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 CYR1YJL005W 6081 nt2.94□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 RSE1YML049C 4086 nt2.93□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 AGC1YPR021C 2709 nt2.93□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 YDL073WYDL073W 2955 nt2.93□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 NMD2YHR077C 3270 nt2.92□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 YOR296WYOR296W 3870 nt2.92□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.92□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 NAB6YML117W 3405 nt2.91□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 YDR209CYDR209C 414 nt2.91□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 RGR1YLR071C 3249 nt2.9□□□□□ -1.94
IOC2Q12072 GCN2YDR283C 4980 nt2.9□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 MYO2YOR326W 4725 nt2.9□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 YEF3YLR249W 3135 nt2.9□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 ESC1YMR219W 4977 nt2.89□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 EST2YLR318W 2655 nt2.88□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 CAF120YNL278W 3183 nt2.87□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 ECM21YBL101C 3354 nt2.86□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 NUP100YKL068W 2880 nt2.85□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 YIL169CYIL169C 2988 nt2.85□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 snR14snR14 160 nt2.84□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 TRA1YHR099W 11235 nt2.84□□□□□ -1.95
IOC2Q12072 snR190snR190 190 nt2.83□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 SIP4YJL089W 2490 nt2.83□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 TRM3YDL112W 4311 nt2.82□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 YOR055WYOR055W 435 nt2.82□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 RDS3YPR094W 324 nt2.82□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 REV3YPL167C 4515 nt2.82□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 YPR160W-AYPR160W-A 81 nt2.81□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 SYH1YPL105C 2550 nt2.81□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 CBF2YGR140W 2871 nt2.81□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 ILS1YBL076C 3219 nt2.81□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 CHS1YNL192W 3396 nt2.81□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 snR69snR69 101 nt2.8□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 snR40snR40 97 nt2.8□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 TOF1YNL273W 3717 nt2.8□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 INP51YIL002C 2841 nt2.8□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 ESL2YKR096W 3588 nt2.8□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 TRL1YJL087C 2484 nt2.79□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 CTR9YOL145C 3234 nt2.79□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 GYP5YPL249C 2685 nt2.79□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 MSB2YGR014W 3921 nt2.79□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 VPS8YAL002W 3825 nt2.78□□□□□ -1.96
IOC2Q12072 YPL216WYPL216W 3309 nt2.77□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 NUM1YDR150W 8247 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YER138CYER138C 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YER160CYER160C 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YJR027WYJR027W 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YML039WYML039W 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YML045WYML045W 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YMR050CYMR050C 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.76□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 TCB2YNL087W 3537 nt2.75□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 IRE1YHR079C 3348 nt2.74□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 GEA1YJR031C 4227 nt2.74□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.74□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 SAC3YDR159W 3906 nt2.73□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 RTT101YJL047C 2529 nt2.73□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 TFC3YAL001C 3483 nt2.72□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 SXM1YDR395W 2835 nt2.72□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 SSN2YDR443C 4263 nt2.72□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 BCK1YJL095W 4437 nt2.72□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 PAN2YGL094C 3348 nt2.71□□□□□ -1.97
IOC2Q12072 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.71□□□□□ -1.98
IOC2Q12072 TOR1YJR066W 7413 nt2.7□□□□□ -1.98
IOC2Q12072 PDR1YGL013C 3207 nt2.7□□□□□ -1.98
IOC2Q12072 PKH3YDR466W 2697 nt2.69□□□□□ -1.98
IOC2Q12072 YAR009CYAR009C 3591 nt2.69□□□□□ -1.98
IOC2Q12072 PSD2YGR170W 3417 nt2.69□□□□□ -1.98
IOC2Q12072 YDL114W-AYDL114W-A 114 nt2.67□□□□□ -1.98
IOC2Q12072 CSE1YGL238W 2883 nt2.67□□□□□ -1.98
IOC2Q12072 SGS1YMR190C 4344 nt2.66□□□□□ -1.98
IOC2Q12072 ROM2YLR371W 4071 nt2.65□□□□□ -1.99
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