Protein–RNA interactions for Protein: Q08960

TYW1, S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TYW1Q08960 KAP120YPL125W 3099 nt2.77□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 POL5YEL055C 3069 nt2.77□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 IST2YBR086C 2841 nt2.76□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 GLG1YKR058W 1851 nt2.76□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 SCD5YOR329C 2619 nt2.76□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 RTT101YJL047C 2529 nt2.76□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 PDR11YIL013C 4236 nt2.76□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 RSM22YKL155C 1887 nt2.75□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 SEY1YOR165W 2331 nt2.75□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.75□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 CYR1YJL005W 6081 nt2.75□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 SAC3YDR159W 3906 nt2.74□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 ROM2YLR371W 4071 nt2.74□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 ESC1YMR219W 4977 nt2.74□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 SEC1YDR164C 2175 nt2.74□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 TOM1YDR457W 9807 nt2.74□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 AXL1YPR122W 3627 nt2.74□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 FLO11YIR019C 4104 nt2.73□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 UBR1YGR184C 5853 nt2.73□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 PAN2YGL094C 3348 nt2.73□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 YDR209CYDR209C 414 nt2.73□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 YDR210WYDR210W 228 nt2.73□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 GIP3YPL137C 3831 nt2.73□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 RPS26AYGL189C 360 nt2.72□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt2.72□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 YOL164W-AYOL164W-A 183 nt2.72□□□□□ -1.97
TYW1Q08960 YPR097WYPR097W 3222 nt2.71□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 TAH1YCR060W 336 nt2.71□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 MYO2YOR326W 4725 nt2.71□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 ALY2YJL084C 3141 nt2.71□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 NUT1YGL151W 3399 nt2.7□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 SFB2YNL049C 2631 nt2.7□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 MSB1YOR188W 3414 nt2.7□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 NUM1YDR150W 8247 nt2.7□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt2.69□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 YBR109W-AYBR109W-A 225 nt2.69□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 snR64snR64 101 nt2.68□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt2.68□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 MOT1YPL082C 5604 nt2.68□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 MDS3YGL197W 4464 nt2.68□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 ESL1YIL151C 3357 nt2.67□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 LCL1YPL056C 306 nt2.66□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 BNR1YIL159W 4128 nt2.65□□□□□ -1.98
TYW1Q08960 YCS4YLR272C 3531 nt2.65□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 SPO24YPR036W-A 204 nt2.65□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.64□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 RTP1YMR185W 2946 nt2.64□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 ASE1YOR058C 2658 nt2.64□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YER078W-AYER078W-A 165 nt2.64□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 UTP21YLR409C 2820 nt2.64□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.63□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt2.63□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.63□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 SEC7YDR170C 6030 nt2.63□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 ORC3YLL004W 1851 nt2.62□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 IRC20YLR247C 4671 nt2.62□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 CDC25YLR310C 4770 nt2.62□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 MMS4YBR098W 2076 nt2.62□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 RAD9YDR217C 3930 nt2.61□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YLR232WYLR232W 348 nt2.61□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.61□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 FAB1YFR019W 6837 nt2.61□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 ECM29YHL030W 5607 nt2.6□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 SEC31YDL195W 3822 nt2.6□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 TOF1YNL273W 3717 nt2.59□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YML002WYML002W 2214 nt2.59□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 TIM9YEL020W-A 264 nt2.59□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.59□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YOR055WYOR055W 435 nt2.59□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 YLR422WYLR422W 5799 nt2.59□□□□□ -1.99
TYW1Q08960 SEC16YPL085W 6588 nt2.59□□□□□ -2
TYW1Q08960 HER1YOR227W 3741 nt2.58□□□□□ -2
TYW1Q08960 GYP5YPL249C 2685 nt2.58□□□□□ -2
TYW1Q08960 MYO4YAL029C 4416 nt2.58□□□□□ -2
TYW1Q08960 EMC5YIL027C 426 nt2.58□□□□□ -2
TYW1Q08960 TRA1YHR099W 11235 nt2.57□□□□□ -2
TYW1Q08960 PEP1YBL017C 4740 nt2.57□□□□□ -2
TYW1Q08960 SVL3YPL032C 2478 nt2.57□□□□□ -2
TYW1Q08960 CCH1YGR217W 6120 nt2.56□□□□□ -2
TYW1Q08960 PSD2YGR170W 3417 nt2.56□□□□□ -2
TYW1Q08960 snR47snR47 99 nt2.56□□□□□ -2
TYW1Q08960 snR50snR50 90 nt2.56□□□□□ -2
TYW1Q08960 YEF3YLR249W 3135 nt2.55□□□□□ -2
TYW1Q08960 RAV1YJR033C 4074 nt2.55□□□□□ -2
TYW1Q08960 STH1YIL126W 4080 nt2.55□□□□□ -2
TYW1Q08960 NUP157YER105C 4176 nt2.55□□□□□ -2
TYW1Q08960 COA6YMR244C-A 315 nt2.54□□□□□ -2
TYW1Q08960 HIR3YJR140C 4947 nt2.54□□□□□ -2
TYW1Q08960 NOP9YJL010C 2001 nt2.53□□□□□ -2
TYW1Q08960 UTP22YGR090W 3714 nt2.53□□□□□ -2
TYW1Q08960 VPS13YLL040C 9435 nt2.53□□□□□ -2.01
TYW1Q08960 SMC1YFL008W 3678 nt2.52□□□□□ -2.01
TYW1Q08960 YLR041WYLR041W 321 nt2.51□□□□□ -2.01
TYW1Q08960 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.51□□□□□ -2.01
TYW1Q08960 snR75snR75 89 nt2.49□□□□□ -2.01
TYW1Q08960 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.49□□□□□ -2.01
TYW1Q08960 YAR009CYAR009C 3591 nt2.49□□□□□ -2.01
TYW1Q08960 SXM1YDR395W 2835 nt2.48□□□□□ -2.01
TYW1Q08960 YDL073WYDL073W 2955 nt2.47□□□□□ -2.01
TYW1Q08960 RAD50YNL250W 3939 nt2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.3 ms