Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF85Q03923 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF85Q03923 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms