Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREMQ03060 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREMQ03060 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREMQ03060 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREMQ03060 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREMQ03060 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREMQ03060 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CREMQ03060 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CREMQ03060 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CREMQ03060 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREMQ03060 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREMQ03060 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CREMQ03060 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CREMQ03060 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CREMQ03060 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CREMQ03060 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms