Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OC90Q02509 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OC90Q02509 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OC90Q02509 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OC90Q02509 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OC90Q02509 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OC90Q02509 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms