Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FLI1Q01543 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms