Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RAB11AP62491 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB11AP62491 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms