Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB2AP61019 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB2AP61019 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms