Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CABP4P57796 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CABP4P57796 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CABP4P57796 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CABP4P57796 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CABP4P57796 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP4P57796 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP4P57796 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP4P57796 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP4P57796 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP4P57796 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP4P57796 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP4P57796 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CABP4P57796 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CABP4P57796 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP4P57796 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP4P57796 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP4P57796 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP4P57796 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP4P57796 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP4P57796 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP4P57796 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CABP4P57796 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CABP4P57796 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CABP4P57796 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms