Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
H2BFSP57053 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2BFSP57053 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms