Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BACE1P56817 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BACE1P56817 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BACE1P56817 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BACE1P56817 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BACE1P56817 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BACE1P56817 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BACE1P56817 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BACE1P56817 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BACE1P56817 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BACE1P56817 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BACE1P56817 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BACE1P56817 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BACE1P56817 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms