Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX10P56693 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX10P56693 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX10P56693 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX10P56693 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX10P56693 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX10P56693 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX10P56693 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX10P56693 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX10P56693 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX10P56693 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX10P56693 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX10P56693 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX10P56693 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX10P56693 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX10P56693 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms