Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCL23P55773 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCL23P55773 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCL23P55773 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCL23P55773 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL23P55773 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL23P55773 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL23P55773 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL23P55773 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL23P55773 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL23P55773 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL23P55773 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL23P55773 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCL23P55773 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCL23P55773 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCL23P55773 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCL23P55773 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCL23P55773 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL23P55773 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL23P55773 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL23P55773 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL23P55773 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL23P55773 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL23P55773 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL23P55773 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL23P55773 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCL23P55773 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms