Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP9P55211 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP9P55211 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP9P55211 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP9P55211 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP9P55211 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP9P55211 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms