Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CRISP1P54107 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CRISP1P54107 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms