Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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PGGT1BP53609 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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PGGT1BP53609 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PGGT1BP53609 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
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