Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF138P52744 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms