Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCAMP50895 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCAMP50895 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCAMP50895 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCAMP50895 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BCAMP50895 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BCAMP50895 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BCAMP50895 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BCAMP50895 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCAMP50895 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCAMP50895 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms