Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZEB1P37275 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZEB1P37275 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZEB1P37275 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZEB1P37275 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZEB1P37275 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZEB1P37275 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ZEB1P37275 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
ZEB1P37275 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ZEB1P37275 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms