Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP7BP35670 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ATP7BP35670 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP7BP35670 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATP7BP35670 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7BP35670 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7BP35670 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7BP35670 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATP7BP35670 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ATP7BP35670 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7BP35670 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7BP35670 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7BP35670 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7BP35670 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7BP35670 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ATP7BP35670 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATP7BP35670 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms