Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ABCD1P33897 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABCD1P33897 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms