Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GBP1P32455 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GBP1P32455 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GBP1P32455 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GBP1P32455 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP1P32455 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP1P32455 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP1P32455 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP1P32455 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP1P32455 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP1P32455 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP1P32455 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GBP1P32455 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GBP1P32455 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GBP1P32455 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GBP1P32455 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms