Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CPS1P31327 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CPS1P31327 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CPS1P31327 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CPS1P31327 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CPS1P31327 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CPS1P31327 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPS1P31327 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPS1P31327 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPS1P31327 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPS1P31327 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPS1P31327 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPS1P31327 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPS1P31327 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CPS1P31327 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CPS1P31327 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CPS1P31327 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPS1P31327 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPS1P31327 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPS1P31327 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPS1P31327 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CPS1P31327 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms