Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC27P30260 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC27P30260 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC27P30260 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC27P30260 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDC27P30260 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDC27P30260 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDC27P30260 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms