Protein–RNA interactions for Protein: P28777

ARO2, Chorismate synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ARO2P28777 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.16□□□□□ -2.22
ARO2P28777 SET3YKR029C 2256 nt1.16□□□□□ -2.22
ARO2P28777 YDL196WYDL196W 330 nt1.16□□□□□ -2.22
ARO2P28777 COA6YMR244C-A 315 nt1.16□□□□□ -2.22
ARO2P28777 CDC39YCR093W 6327 nt1.16□□□□□ -2.22
ARO2P28777 ADR1YDR216W 3972 nt1.15□□□□□ -2.23
ARO2P28777 OLI1Q0130 231 nt1.15□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.15□□□□□ -2.23
ARO2P28777 BST1YFL025C 3090 nt1.14□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YAR009CYAR009C 3591 nt1.14□□□□□ -2.23
ARO2P28777 TUS1YLR425W 3924 nt1.14□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.14□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.13□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YJL150WYJL150W 303 nt1.13□□□□□ -2.23
ARO2P28777 AIM44YPL158C 2277 nt1.13□□□□□ -2.23
ARO2P28777 APL3YBL037W 3078 nt1.12□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.12□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YNL211CYNL211C 261 nt1.12□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YNL337WYNL337W 255 nt1.12□□□□□ -2.23
ARO2P28777 ALY2YJL084C 3141 nt1.12□□□□□ -2.23
ARO2P28777 MMS4YBR098W 2076 nt1.11□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YLL054CYLL054C 2532 nt1.11□□□□□ -2.23
ARO2P28777 RAD9YDR217C 3930 nt1.1□□□□□ -2.23
ARO2P28777 ULI1YFR026C 510 nt1.1□□□□□ -2.23
ARO2P28777 RPS30BYOR182C 192 nt1.1□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YOR225WYOR225W 330 nt1.1□□□□□ -2.23
ARO2P28777 PAA1YDR071C 576 nt1.09□□□□□ -2.23
ARO2P28777 YEL014CYEL014C 306 nt1.09□□□□□ -2.23
ARO2P28777 ISD11YER048W-A 285 nt1.09□□□□□ -2.23
ARO2P28777 snR52snR52 92 nt1.09□□□□□ -2.23
ARO2P28777 EST2YLR318W 2655 nt1.08□□□□□ -2.24
ARO2P28777 TRM3YDL112W 4311 nt1.08□□□□□ -2.24
ARO2P28777 AZF1YOR113W 2745 nt1.08□□□□□ -2.24
ARO2P28777 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.08□□□□□ -2.24
ARO2P28777 RPL33BYOR234C 324 nt1.08□□□□□ -2.24
ARO2P28777 MSH3YCR092C 3057 nt1.08□□□□□ -2.24
ARO2P28777 RSM22YKL155C 1887 nt1.07□□□□□ -2.24
ARO2P28777 SWI4YER111C 3282 nt1.07□□□□□ -2.24
ARO2P28777 COY1YKL179C 2040 nt1.07□□□□□ -2.24
ARO2P28777 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.07□□□□□ -2.24
ARO2P28777 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt1.07□□□□□ -2.24
ARO2P28777 WAR1YML076C 2835 nt1.07□□□□□ -2.24
ARO2P28777 PMP1YCR024C-A 123 nt1.06□□□□□ -2.24
ARO2P28777 YLL020CYLL020C 306 nt1.06□□□□□ -2.24
ARO2P28777 COX12YLR038C 252 nt1.06□□□□□ -2.24
ARO2P28777 STB6YKL072W 2301 nt1.05□□□□□ -2.24
ARO2P28777 EAF1YDR359C 2949 nt1.05□□□□□ -2.24
ARO2P28777 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.04□□□□□ -2.24
ARO2P28777 CMC4YMR194C-B 222 nt1.04□□□□□ -2.24
ARO2P28777 PAN2YGL094C 3348 nt1.04□□□□□ -2.24
ARO2P28777 SMC1YFL008W 3678 nt1.03□□□□□ -2.24
ARO2P28777 YJL182CYJL182C 318 nt1.03□□□□□ -2.24
ARO2P28777 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.03□□□□□ -2.24
ARO2P28777 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.03□□□□□ -2.24
ARO2P28777 snR46snR46 197 nt1.03□□□□□ -2.24
ARO2P28777 ASE1YOR058C 2658 nt1.02□□□□□ -2.25
ARO2P28777 Q0032Q0032 291 nt1.02□□□□□ -2.25
ARO2P28777 YGR151CYGR151C 336 nt1.02□□□□□ -2.25
ARO2P28777 PRP39YML046W 1890 nt1.02□□□□□ -2.25
ARO2P28777 YNL338WYNL338W 159 nt1.02□□□□□ -2.25
ARO2P28777 LAA1YJL207C 6045 nt1.02□□□□□ -2.25
ARO2P28777 DOP1YDR141C 5097 nt1.02□□□□□ -2.25
ARO2P28777 APL1YJR005W 2103 nt1.01□□□□□ -2.25
ARO2P28777 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.01□□□□□ -2.25
ARO2P28777 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.01□□□□□ -2.25
ARO2P28777 CAT8YMR280C 4302 nt1.01□□□□□ -2.25
ARO2P28777 VAM6YDL077C 3150 nt1.01□□□□□ -2.25
ARO2P28777 CDC25YLR310C 4770 nt1□□□□□ -2.25
ARO2P28777 NOP9YJL010C 2001 nt1□□□□□ -2.25
ARO2P28777 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1□□□□□ -2.25
ARO2P28777 SAC3YDR159W 3906 nt1□□□□□ -2.25
ARO2P28777 TRS65YGR166W 1683 nt1□□□□□ -2.25
ARO2P28777 ANS1YHR126C 480 nt0.99□□□□□ -2.25
ARO2P28777 YPL044CYPL044C 549 nt0.99□□□□□ -2.25
ARO2P28777 TTI1YKL033W 3117 nt0.99□□□□□ -2.25
ARO2P28777 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.97□□□□□ -2.25
ARO2P28777 CDC31YOR257W 486 nt0.97□□□□□ -2.25
ARO2P28777 HAL9YOL089C 3093 nt0.97□□□□□ -2.25
ARO2P28777 RKR1YMR247C 4689 nt0.97□□□□□ -2.25
ARO2P28777 YLR294CYLR294C 330 nt0.96□□□□□ -2.26
ARO2P28777 YBL053WYBL053W 375 nt0.96□□□□□ -2.26
ARO2P28777 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.95□□□□□ -2.26
ARO2P28777 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.95□□□□□ -2.26
ARO2P28777 YLR282CYLR282C 342 nt0.95□□□□□ -2.26
ARO2P28777 BFR2YDR299W 1605 nt0.95□□□□□ -2.26
ARO2P28777 UBP3YER151C 2739 nt0.95□□□□□ -2.26
ARO2P28777 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.94□□□□□ -2.26
ARO2P28777 SPT7YBR081C 3999 nt0.94□□□□□ -2.26
ARO2P28777 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt0.93□□□□□ -2.26
ARO2P28777 CLU1YMR012W 3834 nt0.93□□□□□ -2.26
ARO2P28777 YGR130CYGR130C 2451 nt0.92□□□□□ -2.26
ARO2P28777 NST1YNL091W 3723 nt0.92□□□□□ -2.26
ARO2P28777 snR190snR190 190 nt0.92□□□□□ -2.26
ARO2P28777 YCS4YLR272C 3531 nt0.92□□□□□ -2.26
ARO2P28777 SEC3YER008C 4011 nt0.92□□□□□ -2.26
ARO2P28777 MSN5YDR335W 3675 nt0.91□□□□□ -2.26
ARO2P28777 YEL073CYEL073C 324 nt0.9□□□□□ -2.27
ARO2P28777 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ARO2P28777 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
ARO2P28777 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 922 ms