Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPRGP23470 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRGP23470 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPRGP23470 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
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