Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NF1P21359 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NF1P21359 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NF1P21359 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NF1P21359 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NF1P21359 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NF1P21359 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NF1P21359 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NF1P21359 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NF1P21359 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NF1P21359 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NF1P21359 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NF1P21359 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NF1P21359 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NF1P21359 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NF1P21359 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NF1P21359 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms