Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RAB4AP20338 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms