Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYN1P17600 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYN1P17600 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYN1P17600 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYN1P17600 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYN1P17600 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYN1P17600 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYN1P17600 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYN1P17600 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYN1P17600 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYN1P17600 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms