Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CREB1P16220 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CREB1P16220 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CREB1P16220 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CREB1P16220 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CREB1P16220 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CREB1P16220 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms