Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT1P13805 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT1P13805 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms