Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL5P13501 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL5P13501 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL5P13501 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL5P13501 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL5P13501 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL5P13501 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL5P13501 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms