Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHV1-8P0DP01 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV1-8P0DP01 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms