Protein–RNA interactions for Protein: P07205

PGK2, Phosphoglycerate kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGK2P07205 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGK2P07205 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGK2P07205 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGK2P07205 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGK2P07205 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGK2P07205 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK2P07205 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK2P07205 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK2P07205 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK2P07205 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK2P07205 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK2P07205 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGK2P07205 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms