Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VTNP04004 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VTNP04004 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VTNP04004 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
VTNP04004 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VTNP04004 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VTNP04004 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VTNP04004 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VTNP04004 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTNP04004 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTNP04004 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTNP04004 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTNP04004 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTNP04004 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTNP04004 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTNP04004 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTNP04004 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VTNP04004 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms