Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYF2O95926 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYF2O95926 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SYF2O95926 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SYF2O95926 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYF2O95926 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYF2O95926 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms