Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FOXD2O60548 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms