Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC31.82■■■□□ 2.69
KIAA0556O60303 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
KIAA0556O60303 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
KIAA0556O60303 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms