Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms