Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DENRO43583 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DENRO43583 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
DENRO43583 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DENRO43583 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DENRO43583 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DENRO43583 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DENRO43583 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DENRO43583 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms