Protein–RNA interactions for Protein: O15259

NPHP1, Nephrocystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP1O15259 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP1O15259 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP1O15259 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP1O15259 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP1O15259 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP1O15259 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP1O15259 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP1O15259 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPHP1O15259 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NPHP1O15259 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPHP1O15259 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms