Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
APAF1O14727 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
APAF1O14727 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
APAF1O14727 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APAF1O14727 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APAF1O14727 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APAF1O14727 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APAF1O14727 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
APAF1O14727 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APAF1O14727 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APAF1O14727 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
APAF1O14727 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APAF1O14727 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
APAF1O14727 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
APAF1O14727 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APAF1O14727 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APAF1O14727 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APAF1O14727 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APAF1O14727 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
APAF1O14727 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
APAF1O14727 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms