Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPRTO14522 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPRTO14522 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms