Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TULP1O00294 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TULP1O00294 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TULP1O00294 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TULP1O00294 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TULP1O00294 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TULP1O00294 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms