Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DSR2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DSR2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DSR2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
B4DSR2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
B4DSR2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
B4DSR2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
B4DSR2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
B4DSR2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DSR2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
B4DSR2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms